Os acontecimentos que deram origem à Apis datam de 1869, época de fundação da Loja Maçônica Perseverança III. Na ocasião, a cidade recebia grande número de leprosos e variolosos. O primeiro venerável da Loja Maçônica, Vicente Eufrásio da Silva Abreu, iniciou o projeto de criação de um manicômio para auxiliar esses pacientes. Dentro do projeto, a construção de um hospital começou em 1873 e em 1876 foi concluída a obra do Hospital Santa Rita de Cássia. Essa unidade foi transformada no primeiro manicômio de Sorocaba.