A discussão sobre João Ramalho no IHGSP teve início com a formação de umacomissão que buscava responder a uma indagação levantada no Instituto Histórico eGeográfico Brasileiro (IHGB), pelo consócio José Luis Alves na reunião de 3 de marçode 1899. Enquanto a proposta teve pouca repercussão no próprio IHGB, os paulistas acolheram o tema ederam início a um debate acalorado. A indagação em questão referia-se à veracidade dotestamento de João Ramalho, documento citado pelo monge beneditino Frei Gaspar daMadre de Deus no século XVIII e que não havia sido encontrado por nenhum outrohistoriador até então. Propôs José Luis Alves que se lançassem os historiadores à caçadesse documento, do qual deveria haver “copia na Bibliotheca do mosteiro S. Bento deS. Paulo ou de Santos”, além de procurar averiguar o caso com a documentação dotempo. (RIHGB, 1900: 286)