Rejeitou a proposta de retomar o trono por meio de uma Guerra CivilApós o golpe militar que destronou D. Pedro II, em 15 de novembro de 1889, muitos movimentos que exigiam a restauração da monarquia apareceram no Brasil. Alguns deles misturados a outras reivindicações, como foi o caso das duas Revoltas da Armada, ocorridas no início dos anos 1890. Nesse contexto, a princesa Isabel, que estava exilada com a família em Paris, estaria cotada para assumir o trono, já que seu pai morrera na mesma cidade em 1891. No entanto, Isabel preferiu evitar derramamento de sangue e resignou-se a não mais pretender ser imperatriz do Brasil, como fica claro em um bilhete endereçado ao seu último chefe de gabinete, da Terceira Regência, João Alfredo: "Meu pai, com seu prestígio, teria provavelmente recusado a guerra civil como um meio de retornar à pátria. lamento tudo quanto possa armar irmãos contra irmãos. É assim que tudo se perde e que nós nos perdemos. O senhor conhece meus sentimentos de católica e brasileira.