Afonso Pedro de Alcântara Cristiano Leopoldo Filipe Eugênio Miguel Gabriel Rafael Gonzaga, ou simplesmente Dom Afonso, nasceu no Rio de Janeiro, em 23 de fevereiro de 1845, seu falecimento prematuro fez com que Isabel se tornasse a herdeira presuntiva de seu pai.
Não confundir com D. Pedro Afonso, Príncipe Imperial, irmão mais novo de D. Afonso Pedro e que também morreu prematuramente.
Foi o primogênito do imperador Dom Pedro II do Brasil e da princesa Teresa Cristina das Duas Sicílias e, portanto, membro do ramo brasileiro da Sereníssima Casa de Bragança.
Com o nascimento de seu filho, o inseguro e tímido imperador, que na época tinha 19 anos de idade, tornou-se mais maduro e resoluto.
A chegada de Afonso também promoveu uma relação mais estreita e mais harmoniosa entre seus pais, que haviam se casado devido a um arranjo político.